Os métodos auxiliares de diagnóstico revestem um papel fundamental na prestação de cuidados de saúde. O Instituto do Coração, além dos meios auxiliares de diagnóstico não-invasivos convencionais, foi pioneiro Medicina Nuclear para realização de cintigrafias de perfusão do miocárdio, de esforço e de sobrecarga farmacológica, ainda hoje um dos mais prestigiados e de maior experiência. Igualmente de modo pioneiro, foi criado o Departamento de Reabilitação Cardíaca para doentes após cirurgia cardíaca ou enfartes do miocárdio.